Table 3. Repetitive nucleotide sequences of marker A region for cyprinid herpesvirus-2 (CyHV-2)

Strain GenBank Accession No. Size (bp) Repetitive sequence Length Times
Reference
 ST-J1 JQ815364 432 GCGCGTGGCTTTCGGGTTTCGATTCCGAGTAACTCTCAGATGGGTAACTCCCTGAATAACTCGTTTGTGGCCGTTAGTGGCTGTTGC 87 2
 SaT-1 LC202021 462 TGCGTCACTGGGATGGGCGCGTGGCTTTCGGGTTTCGATTCCGAGTAACTCTCAGATGGGTAACTCCCTGAATAACTCGTTTGTGGCCGTTAGTGGCTGTTGCGCTATTTTGCGCTA 117 2
 SY-C1 KM200722 345 ATGGTTACTCTAAGTGGTCTTAATGGTTACTCT 33 2
 1301 KU199244 345 ATGGTTACTCTAAGTGGTCTTAATGGTTACTCT 33 2
 SY KT387800 345 ATGGTTACTCTAAGTGGTCTTAATGGTTACTCT 33 2
 AMS-3 LC202025 462 TGCGTCACTGGGATGGGCGCGTGGCTTTCGGGTTTCGATTCCGAGTAACTCTCAGATGGGTAACTCCCTGAATAACTCGTTTGTGGCCGTTAGTGGCTGTTGCGCTATTTTGCGCTA 117 2
 AMS-1 LC202022 462 TGCGTCACTGGGATGGGCGCGTGGCTTTCGGGTTTCGATTCCGAGTAACTCTCAGATGGGTAACTCCCTGAATAACTCGTTTGTGGCCGTTAGTGGCTGTTGCGCTATTTTGCGCTA 117 2
 AMS-6 LC202023 458 TGGTTACTCTAAGTGGTCTTAATGGTTACTCTTAATGGTTACTCTCAATGGTTACTCTCAATGGTTACTCTTAGTGGGTACTCTTAGTGGGTACTCTCAG 100 2
 CNDF-TB2015 MN201961 295 AATGGTTACTCTC 13 2
 YZ-01 MK260012 295 AATGGTTACTCTC 13 2
 AMS-08 LC202024 297 AATGGTTACTCTC 13 2
 RSD-PL KX852452 295 AATGGTTACTCTC 13 2
 FR 295 AATGGTTACTCTC 13 2
In this study
 ThGf-2101A-Cy 343 ATGGTTACTCTAAGTGGTCTTAATGGTTACTCT 33 2
 ThGf-2101B-Cy 343 ATGGTTACTCTAAGTGGTCTTAATGGTTACTCT 33 2
 ThGf-2107-Cy 295 AATGGTTACTCTC 13 2